《摧花谜墓第三季》延续前作悬疑基调，故事围绕刑警队长林寒与法医顾言联手侦破连环命案展开。本季的核心案件与一座荒废多年的民国墓园有关，多名年轻女性相继失踪，被发现时均被安放在墓园不同角落，身旁留有诡异的花卉图案，仿佛某种仪式。随着调查深入，林寒发现这些受害者都与一桩尘封十年的校园旧案存在隐秘关联，而当年唯一幸存者、如今已成为植物人的女孩叶薇，正是破解谜团的关键。与此同时，顾言在尸检中发现了一种罕见毒素，指向一个早已被注销的医药研究所。幕后黑手身份成谜，似乎对警方行动了如指掌，不断制造假象干扰侦查。在追查过程中，林寒被迫直面自己妹妹当年意外身亡的真相，顾言也陷入职业伦理与私人情感的挣扎。最终，两人在墓园地下发现了一处被精心布置的“审判室”，揭开了凶手以“净化”为名、行私刑报复之实的扭曲心理。真相浮出水面之际，一场生死对峙也随之展开。
